A Hades 2 bejelentő előzetese egyértelművé tette, hogy a folytatás sem fog túlságosan eltérni az első játékban nyújtott élménytől. Zagreus helyett azonban a játékosok egy új, Melinoe nevű boszorkány-karaktert irányíthatnak. A lány megemlíti, hogy apját üldözi, aki a jelek szerint maga Hádész, akit Kronosz láncra vert és foglyul ejtett. A Hades 2 már elérhető korai hozzáférésben és sok rajongót foglalkoztat a kérdés, hogy hol van Zagreus? A játék erre ad némi magyarázatot, de innentől spoilerek.
Ha elbuksz a Kronosz elleni csatában, akkor bejöhet egy flashback, amiben magával Hádésszel kell menni. Ekkor láthatod, hogy mikor átvette a hatalmat az Alvilágban, több embert is megfagyasztott az időben, méghozzá furcsa kocka alakokban, köztük Nyxet, Dusát és igen, magát Zagreust is. Kronosz tehát csapdába ejtette őket, de az legalább kiderül ebből a jelenetből, hogy biztosan élnek.
