Egy újabb terroristaveszély megállítása körül bonyolódó történet, valamint a kémeket és zsoldosokat két játékmódban egymással szembe állító multiplayer mód mellett a Splinter Cell: Blacklist egy kooperatív oldallal is rendelkezik, melyben társunkkal a sztorihoz csak marginálisan kapcsolódó küldetéseket teljesíthetünk, általában valamilyen nehezítő körülmény mellett.
Az alábbi videóban a Ubisoft a Sea Fort című co-op misszió egy részletét mutatja be, melyet régi kapcsolattartónk, Grim bízott ránk, a követelmény pedig az, hogy az őrök ne vegyenek észre, különben oda a megbízatás -- vagyis a sorozat korai részeit idéző szigorúság mellett kell végigosonunk a hajón a célunkig.