A Supernatural középpontjában egy bizonyos Wyatt nyomozó áll, aki egy fiatalembertől kap egy e-mailt a szobalánya, Mrs. Susan rejtélyes eltűnésével kapcsolatban. A szobalány korábban a férfi házára és terhes menyasszonyára vigyázott, amíg a pasas dolgozott. Wyatt nyomozó nekiáll kideríteni az igazságot, és nekivág az ismeretlennek, hogy kinyomozza, mi a frász is történt valójában Mrs. Susannal.
A rejtvényekre összpontosító Supernatural a manapság trendi horror-mechanikát is alkalmazza, vagyis a mikrofonod segítségével kommunikálhatsz a házban lévő természetfeletti entitással. A játék azonban más hangokat is észlel, amelyek meghatározzák a természetfeletti események gyakoriságát. Minél hangosabb vagy, a játék annál ijesztőbb eseményeket dobál be. Attól függően, hogy milyen cselekedeteket választasz, három különböző befejezés vár rád a végjátékban. Ki mered deríteni, hogy mi történt Mrs. Susannal?