A Grey Goo története szerint az emberiség túl magas szintre fejlesztette a nanotechnológiát, aminek eredményeként szép lassan felemésztette fajunkat a mikróba méretű robotok inváziója. A csak "szürke ragacsnak" nevezett esemény létrehozta a Goo nevű mutáns fajt, akik eleve nem viszonyultak túl jól az emberekhez. És ha ez még nem lett volna elég, a Bétának nevezett idegen faj is belépett a képbe.
A Grey Goo három eltérp frakciója más-más technolgóiát és stratégiát jelent, ám a játékmenet mindig ugyanazt a célt tűzi ki: a játékosnak nem a menedzsmenttel és az egységket roborzásával kell foglalkoznia elsősorban, hanem a taktika kidolgozásával és a bázis felhúzásával, mely utóbbi kiemelten fontos szerepet kap a Grey Goo-ban.
A játék látányos 3D-s környezetben játszódik, és az epizódonként érkező kampányon túl multiplayer komponenst is tartalmaz -- sőt, utóbbin van a hansgsúly igazán.
