Az X3: Terran Conflict nagyon merész játékmenetbeli bogarakkal jött a világra, a készítők igyekeznek minden hibát orvosolni, erre bizonyíték az 1.3-as patch, íme a foltozások:

• Új parancs a Szállító Drónok számára,

• Javítva a hajógyár kereskedelmi menüje,

• Küldetések és díjak újrahangolva,

• A küldetés informátor játék közben letilthatóvá téve,

• És még jó pár változtatás hozzáadva.