8 GB, vagy annál is nagyobb SD-kártyára lesz szüksége annak, aki a digitális változatát veszi meg a Xenoblade Chronicles 3D-nek, tudtuk meg a Nintendótól. Szóval, ha a New 3DS-edben vagy a New 3DS XL-edben csak 4 GB-os kártya van, és játszani szeretnél e programmal, akkor jobb, ha szerzel egy nagyobbat – vagy megveszed a játék április 2-án megjelenő dobozos változatát.
Hiro Jamada szerint a játék mérete egyrészt köszönhető annak, hogy majdnem száz órába telik kipörgetni, plusz az eredeti Wii-s változathoz képest alaposan felturbózott grafika is rátett egy lapáttal a Xenoblade Chronicles 3D méretére, amit nem lehetett egyszerűen portolni, mivel a New 3DS technikai feltételei mások, mint amilyenek a Wii-é voltak, beleértve ebbe a processzort és a gombkiosztást is. Éppen ezért rengeteg trükköt vetettek be, hogy teljes legyen a vizuális élmény.